🧬 COPD合并糖尿病核心基因筛选与验证

一套从生物信息学到实验验证再到论文发表的完整科研教学系统

📚 课程讲义

💻 配套代码


📋 模板与工具

🎯 快速入口


📊 学习进度

  • ⬜ 环境准备与R基础
  • ⬜ 数据预处理与差异分析
  • ⬜ 机器学习核心基因筛选
  • ⬜ 功能富集与网络分析
  • ⬜ 细胞实验验证
  • ⬜ 网络药理学与分子对接
  • ⬜ 论文写作与投稿

📅 7周学习路线

第1周：环境 + R语言 + 数据获取 产出：干净表达矩阵
第2周：差异分析 + 机器学习 产出：3-5个核心基因
第3周：富集分析 + PPI网络 产出：分析图表
第4周：实验设计 产出：实验方案
第5周：细胞实验实操 产出：实验数据
第6周：网络药理学 + 分子对接 产出：候选药物 + 对接图
第7周：论文写作 产出：论文初稿

⚡ 5分钟快速开始

# 1. 安装R和RStudio
# https://cran.r-project.org/
# https://posit.co/download/rstudio-desktop/

# 2. 安装必要包
install.packages(c("tidyverse", "ggplot2", "pheatmap", "VennDiagram", 
                   "randomForest", "glmnet", "caret", "e1071", "pROC",
                   "igraph", "ggraph"))

# 3. Bioconductor包
if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(c("GEOquery", "limma", "clusterProfiler", 
                        "org.Hs.eg.db", "enrichplot"))

# 4. 设置工作目录
setwd("/path/to/kaoyan")

# 5. 打开 curriculum/00-课程介绍与学习路线图.md 开始学习！